總統府發言人郭雅慧今 (15) 日表示，總統賴清德今 (15) 日在公布財政收支劃分法修正條文令文案批示，本法修正破壞財政永續，在行政院長卓榮泰加註不予副署之意見下，總統府以示恪盡憲法忠誠義務與維護國家財政健全之嚴正立場。總統府也箋函予五院院長。
郭雅慧說明，總統批示內容如下：前次修法已有侵犯行政權之虞，行政院已聲請釋憲在案，此次修法不僅削弱中央財政，影響施政決策，且擴大中央地方垂直及水平分配不均，破壞財政永續，加劇排擠政府推動重要民生政策，阻損守護國家安全及因應天然災變之能力。在各方允應在合憲途徑下，應建構兼顧中央財政韌性與地方均衡發展，讓國家能長治久安之制度。
郭雅慧說明，卓榮泰加註意見為：「依憲法第 37 條規定，總統依法公布法律，須經行政院長副署。而在憲法上，行政院與立法院分別有預算提案權與議決權，以形成國家預算秩序。惟立法院本次修正財劃法，過程與內容悖離民主原則及權力分立，侵害行政院行政權，違憲重大且明顯。是本人為維護憲法賦予之預算編列權並承擔施政責任，決定基於行政院院長副署權，就本次財劃法修正條文不予副署，以示對憲法之忠誠。」
郭雅慧補充，立法院在今 (2025) 年 11 月 14 日三讀通過修正財政收支劃分法，經行政院移請立法院覆議後，立法院於 12 月 5 日投票表決維持原決議，同日咨請總統公布。
據憲法法庭資料指出，第 37 條規定，「總統依法公布法律，發布命令，須經行政院院長之副署，或行政院院長及有關部會首長之副署」，若不副署就是行政院不同意立法院通過的法律所執行的舉動，只要行政院長不副署，法案也就不生效。
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